孕期亲子鉴定主要分为四种：穿刺取羊水、胎儿绒毛、无创胎儿亲子鉴定以及羊水绒毛混合鉴定。然而，羊水和绒毛在采集样本的过程中，可能对胎儿和孕妇产生伤害，因此，这种方法已经被淘汰。现在，无创胎儿亲子鉴定由于不会对胎儿和孕妇产生任何伤害，且可以在怀孕5周以上就可以进行检测，因此，孕期亲子鉴定基本上都选择无创胎儿亲子鉴定。

无创胎儿亲子鉴定是一种利用新一代高通量测序平台对母体外周血中的游离DNA片段（包括胎儿游离DNA）进行测序、生物信息分析，从中获取胎儿的DNA遗传信息，同时，根据孟德尔遗传规律比对分析假定父亲DNA信息来实现亲子关系的鉴定。采用捕获方法富集SNP位点数约13000个。

无创胎儿亲子鉴定的流程包括：

1. 孕妇血液的采集：必须由护士或者法医用专用采血工具进行采集和保存，个人绝对不容许私自采集，一般抽取孕妇手臂10ml静脉血即可。 2. 疑似父样本采集：疑似父样本可以是血液，带毛囊毛发，口腔棉签，指甲，牙刷，烟蒂，精液等。 3. 鉴定时间：普通检测7天内出鉴定结果，如果加急，可以二十四小时内出鉴定结果，同时检测费用要增加不少。

不论哪种方式，只要能提取到胎儿的DNA，那么亲子鉴定结果的准确率大于99.99%。根据孟德尔遗传定律，孩子全部遗传基因来源于其亲生父母双方。

无创产前亲子鉴定技术在国内兴起于2014年，随后几年得以快速发展，鉴定机构如雨后春笋般冒出来。2014年从事无创胎儿亲子鉴定后，初步统计，本人经手的检测大概有800多例，从鉴定结果来说，目前没有发现一起出生后鉴定结果与出生前不一致的案例。所以从理论和实际数据来看，无创胎儿亲子鉴定的准确率是有充分保障的。